UROD

Šablon:Infokutija gen Uroporpfirinogen III dekarboksilaza (uroporfirinogen dekarboksilaza ili UROD) jest enzim (EC 4.1.1.37) koji je kod ljudi kodiran genom UROD sa hromosoma 1.^[1]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 367 aminokiselina, a molekulska težina 40.787 Da.^[2] Šablon:Legenda aminokiselina

10	20	30	40	50
MEANGLGPQG	FPELKNDTFL	RAAWGEETDY	TPVWCMRQAG	RYLPEFRETR
AAQDFFSTCR	SPEACCELTL	QPLRRFPLDA	AIIFSDILVV	PQALGMEVTM
VPGKGPSFPE	PLREEQDLER	LRDPEVVASE	LGYVFQAITL	TRQRLAGRVP
LIGFAGAPWT	LMTYMVEGGG	SSTMAQAKRW	LYQRPQASHQ	LLRILTDALV
PYLVGQVVAG	AQALQLFESH	AGHLGPQLFN	KFALPYIRDV	AKQVKARLRE
AGLAPVPMII	FAKDGHFALE	ELAQAGYEVV	GLDWTVAPKK	ARECVGKTVT
LQGNLDPCAL	YASEEEIGQL	VKQMLDDFGP	HRYIANLGHG	LYPDMDPEHV
GAFVDAVHKH	SRLLRQN

Funkcija

Uroporfirinogen III dekarboksilaza je homodimerni enzim (Šablon:PDB) koji katalizuje peti korak u heme biosintezi, što odgovara eliminaciji karboksil grupa sa četiri acetatne strane lanci uroporfirinogen III daju koproporfirinogen III:

uroporfirinogen III

⇌

koproporfirinogen III + 4 CO₂

Mehanizam

Pri niskim koncentracijama supstrata, vjeruje se da reakcija slijedi uređeni put, sa sekvencnim uklanjanjem CO₂ iz D, A, B i C prstenova, dok se pri višim razinama supstrata/enzima izgleda da je operativna nasumična ruta. Enzim u rastvoru funkcionira kao dimer, a i enzimi čovjeka i duhana su kristalizirani i riješeni u dobrim rezolucijama.

UROD se smatra neobičnom dekarboksilazom, jer vrši dekarboksilaciju bez intervencije bilo kakvih kofaktora, za razliku od velike većine dekarboksilaza. Nedavno je predloženo da se njegov mehanizam odvija kroz protonaciju supstrata pomoću argininskih ostatka.

Klinički značaj

Poznato je da mutacije i nedostatak ovog enzima uzrokuju porodičnu porphyria cutanea tarda i hepatoeritropoetsku porfiriju.^[1]

Izvještaj iz 2008. pokazao je da je nekatalizirana brzina UroD-ove reakcije 10⁻¹⁹ s⁻¹, tako da je pri pH 10 ubrzanje UroD u odnosu na nekataliziranu brzinu, tj. stručnost, veća negop za bilo koji poznati enzim, 6 x 10²⁴ M⁻¹.^[3]